Die typischen Modellsysteme in der Grundlagenforschung sind zellfreie Systeme und Zellkulturen. Aber auch komplette Pflanzen und Tiere werden untersucht. In der Regel finden die Versuche im Labor statt. Die Messparamter sind objektiv, die Messungen meist standardisierbar, vergleichsweise schnell durchzuführen und wiederholbar. Die Ergebnisse sollen Hinweise auf die Wirkungsweise einzelner Arzneien geben oder insgesamt zur Aufschlüsselung des Wirkmechanismus der Homöopathie beitragen.
 
Zur Bedeutung der Grundlagenforschung in der Homöopathie
Kritiker der Homöopathie behaupten u.a., dass die Erfolge der Homöopathie in der klinischen Forschung lediglich auf den Placeboeffekt zurückzuführen sind. Da es nach der klassischen Definition des Placeboeffektes einen solchen nicht geben kann, wenn objektivierbare Parameter an zellfreien Systemen, Zelllinien oder Organen untersucht werden, stellt die homöopathische Grundlagenforschung ein wichtiges Werkzeug dar, um zu belegen, dass Homöopathie mehr als nur Placeboeffekt ist.

Des Weiteren untersucht die homöopathische Grundlagenforschung die physikalische Beschaffenheit von Niedrig- und Hochpotenzen, um charakteristische Eigenschaften dieser zu identifizieren. Diese Ergebnisse unterstreichen die Wichtigkeit und Besonderheit des homöopathischen Potenziervorgangs und können darüber hinaus auch zur Identifizierung des homöopathischen Wirkmechanismus beitragen.

Besonders in Indien wird die homöopathische Grundlagenforschung auch dazu genutzt, neue Arzneimittel für die Homöopathie zu entdecken. Genau wie in der konventionellen Medizin werden dort Arzneimittel in Modellversuchen (z.B. an Krebszellen oder Bakterienzellen) getestet, um diese, bei Erfolg, später in klinischen Studien mit erkrankten Menschen einsetzen zu können.

Weitere Forschungsschwerpunkte
Darüber hinaus liegt in dem Referat die Zuständigkeit für die beiden Datenbanken
▶ HomBRex (Homeopathy Basic Research experiments) sowie
▶ HomVetCR (Clincal Research on Veterinary Homeopathy)

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